MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Shewanella baltica OS195 chromosome

Total Repeats: 15551

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009997	CAA	2	6	38	43	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_009997	AGTA	2	8	48	55	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_009997	TAG	2	6	143	148	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_009997	TAA	2	6	206	211	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_009997	TGA	2	6	259	264	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_009997	CA	3	6	276	281	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7	NC_009997	T	6	6	306	311	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_009997	T	6	6	353	358	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_009997	GAT	2	6	359	364	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_009997	GGC	2	6	2952	2957	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_009997	GCA	2	6	2972	2977	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_009997	TAGCCT	2	12	3005	3016	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_009997	GA	3	6	4180	4185	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_009997	CTA	2	6	7423	7428	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_009997	TTCG	2	8	7574	7581	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
16	NC_009997	TCG	2	6	7589	7594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_009997	TGA	2	6	7609	7614	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_009997	ATT	2	6	9871	9876	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_009997	GAT	2	6	9924	9929	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_009997	GAT	2	6	9943	9948	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_009997	CGT	2	6	10890	10895	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_009997	AT	3	6	10962	10967	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_009997	TGC	2	6	10979	10984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_009997	T	6	6	10996	11001	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_009997	GCA	2	6	11039	11044	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_009997	TGAAT	2	10	11070	11079	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
27	NC_009997	AAGC	2	8	11091	11098	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
28	NC_009997	TA	4	8	11122	11129	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_009997	TAT	2	6	11153	11158	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_009997	ATT	2	6	11186	11191	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_009997	A	6	6	12282	12287	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_009997	T	6	6	12304	12309	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_009997	T	6	6	15406	15411	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_009997	CTT	2	6	15414	15419	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_009997	TA	3	6	15437	15442	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_009997	TGATG	2	10	16061	16070	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
37	NC_009997	A	6	6	16136	16141	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_009997	T	6	6	16164	16169	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_009997	AAT	2	6	16197	16202	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_009997	AGT	2	6	19471	19476	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_009997	AAG	2	6	19533	19538	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_009997	TGA	2	6	19562	19567	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_009997	CGAG	2	8	19569	19576	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
44	NC_009997	GCA	2	6	19610	19615	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_009997	GAG	2	6	19649	19654	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
46	NC_009997	TTA	2	6	20165	20170	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_009997	ATG	2	6	20585	20590	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_009997	AAC	2	6	21790	21795	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_009997	TGA	2	6	21832	21837	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_009997	TTGC	2	8	21838	21845	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
51	NC_009997	TGT	2	6	21847	21852	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_009997	CAG	2	6	21915	21920	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_009997	AATATT	2	12	21932	21943	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_009997	A	6	6	21967	21972	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_009997	ATT	2	6	21997	22002	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_009997	CCA	2	6	25382	25387	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
57	NC_009997	CT	3	6	25410	25415	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
58	NC_009997	CAG	2	6	25422	25427	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_009997	CAT	2	6	25435	25440	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_009997	TG	3	6	25450	25455	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
61	NC_009997	ACA	2	6	25483	25488	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_009997	TGT	2	6	25761	25766	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_009997	AGATTA	2	12	25775	25786	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
64	NC_009997	ATT	2	6	25807	25812	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_009997	AGCT	2	8	29915	29922	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
66	NC_009997	TCAC	2	8	30244	30251	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
67	NC_009997	TTTA	2	8	30381	30388	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_009997	TAA	2	6	31005	31010	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_009997	A	6	6	31009	31014	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_009997	CTTA	2	8	32512	32519	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
71	NC_009997	AGTT	2	8	36751	36758	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
72	NC_009997	ACTG	2	8	36761	36768	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
73	NC_009997	GTT	2	6	37998	38003	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_009997	CTGGG	2	10	38014	38023	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
75	NC_009997	CAA	2	6	38037	38042	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_009997	TTA	2	6	38043	38048	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_009997	GA	3	6	39569	39574	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
78	NC_009997	AGG	2	6	39576	39581	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
79	NC_009997	CCT	2	6	39588	39593	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
80	NC_009997	T	6	6	39593	39598	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_009997	GGT	2	6	39653	39658	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
82	NC_009997	ATA	2	6	40243	40248	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_009997	TTG	2	6	40250	40255	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_009997	ACCG	2	8	40284	40291	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
85	NC_009997	GCG	2	6	40301	40306	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_009997	AATA	2	8	43648	43655	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_009997	GCC	2	6	43687	43692	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
88	NC_009997	TA	3	6	43698	43703	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_009997	CTAA	2	8	43724	43731	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
90	NC_009997	T	6	6	44303	44308	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_009997	GGTCA	2	10	44334	44343	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
92	NC_009997	GCA	2	6	44503	44508	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_009997	A	6	6	44517	44522	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_009997	GTG	2	6	44593	44598	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
95	NC_009997	TG	3	6	44654	44659	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
96	NC_009997	GTTT	2	8	44761	44768	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
97	NC_009997	A	6	6	44784	44789	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_009997	CAA	2	6	44828	44833	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_009997	GGC	2	6	44876	44881	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_009997	GCG	2	6	44942	44947	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_009997	AGG	2	6	45037	45042	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
102	NC_009997	CGA	2	6	45117	45122	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_009997	GAT	2	6	45142	45147	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_009997	GCA	2	6	45191	45196	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_009997	G	6	6	45216	45221	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
106	NC_009997	GT	3	6	45244	45249	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
107	NC_009997	GAA	2	6	45250	45255	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_009997	GGA	2	6	45286	45291	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
109	NC_009997	AGC	2	6	45297	45302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_009997	AGA	2	6	45333	45338	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_009997	CAG	2	6	45359	45364	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_009997	G	6	6	45506	45511	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
113	NC_009997	GGA	2	6	45550	45555	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
114	NC_009997	GGC	2	6	45570	45575	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_009997	GAA	2	6	45814	45819	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_009997	TGC	2	6	45890	45895	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_009997	GTC	2	6	45902	45907	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_009997	TGG	2	6	45980	45985	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
119	NC_009997	GGA	2	6	46016	46021	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
120	NC_009997	GAC	2	6	46029	46034	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_009997	TCA	2	6	46041	46046	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_009997	AC	3	6	46067	46072	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
123	NC_009997	TCG	2	6	46134	46139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_009997	AC	3	6	46236	46241	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
125	NC_009997	AAG	2	6	46272	46277	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126	NC_009997	G	7	7	46295	46301	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
127	NC_009997	CAC	2	6	46306	46311	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
128	NC_009997	CCT	2	6	46377	46382	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
129	NC_009997	TGTT	2	8	46403	46410	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
130	NC_009997	CA	3	6	46418	46423	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
131	NC_009997	TCT	2	6	46437	46442	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_009997	TGA	2	6	46525	46530	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
133	NC_009997	TGTC	2	8	46531	46538	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
134	NC_009997	TTAC	2	8	46545	46552	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
135	NC_009997	CAT	2	6	46580	46585	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_009997	TTA	2	6	46601	46606	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_009997	ATT	2	6	46631	46636	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_009997	CTT	2	6	46671	46676	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_009997	GTA	2	6	46809	46814	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
140	NC_009997	CAG	2	6	46881	46886	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_009997	GGA	2	6	46960	46965	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
142	NC_009997	TAG	2	6	46989	46994	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
143	NC_009997	GCGA	2	8	46997	47004	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
144	NC_009997	TGA	2	6	47100	47105	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
145	NC_009997	G	6	6	47146	47151	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
146	NC_009997	TCC	2	6	47156	47161	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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148	NC_009997	GGA	2	6	47466	47471	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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292	NC_009997	GC	3	6	95700	95705	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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294	NC_009997	GT	3	6	95779	95784	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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421	NC_009997	GTT	2	6	150607	150612	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
422	NC_009997	GT	3	6	150617	150622	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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427	NC_009997	CGCGA	2	10	154108	154117	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
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